Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Elk1P41969 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Elk1P41969 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms