Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tac1P41539 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tac1P41539 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tac1P41539 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms