Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mmp9P41245 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mmp9P41245 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms