Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col18a1P39061 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Col18a1P39061 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col18a1P39061 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col18a1P39061 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col18a1P39061 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col18a1P39061 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col18a1P39061 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col18a1P39061 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col18a1P39061 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col18a1P39061 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col18a1P39061 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Col18a1P39061 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col18a1P39061 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms