Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc1P34928 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms