Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Saa4P31532 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Saa4P31532 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Saa4P31532 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms