Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa2P31245 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms