Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd9P28357 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms