Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ggta1P23336 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ggta1P23336 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms