Protein–RNA interactions for Protein: P23299

Kcne1, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcne1P23299 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcne1P23299 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcne1P23299 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms