Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eif3aP23116 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eif3aP23116 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eif3aP23116 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eif3aP23116 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eif3aP23116 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eif3aP23116 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eif3aP23116 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eif3aP23116 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eif3aP23116 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eif3aP23116 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eif3aP23116 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms