Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcb1aP21447 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms