Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ntf3P20181 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms