Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NefhP19246 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NefhP19246 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NefhP19246 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NefhP19246 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NefhP19246 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NefhP19246 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NefhP19246 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NefhP19246 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NefhP19246 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NefhP19246 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NefhP19246 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NefhP19246 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NefhP19246 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NefhP19246 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NefhP19246 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NefhP19246 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NefhP19246 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NefhP19246 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NefhP19246 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NefhP19246 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NefhP19246 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NefhP19246 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NefhP19246 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms