Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifrd1P19182 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms