Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms