Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpraP18052 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpraP18052 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpraP18052 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtpraP18052 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpraP18052 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpraP18052 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtpraP18052 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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