Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme1P15532 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nme1P15532 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme1P15532 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme1P15532 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms