Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Il1r1P13504 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il1r1P13504 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms