Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb2P13373 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb2P13373 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms