Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtcP11725 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtcP11725 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtcP11725 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtcP11725 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms