Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolP11369 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolP11369 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolP11369 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolP11369 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolP11369 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolP11369 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolP11369 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolP11369 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolP11369 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms