Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Tnp1P10856 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms