Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254bP0DN90 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254bP0DN90 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms