Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem254aP0DN89 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem254aP0DN89 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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