Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Igsf6P0C6B7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms