Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms