Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hoxb7P09024 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms