Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtrP07309 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtrP07309 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms