Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgfb1P04202 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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