Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa7P02830 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa7P02830 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms