Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp8O89110 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms