Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccl20O89093 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ccl20O89093 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ccl20O89093 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ccl20O89093 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ccl20O89093 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ccl20O89093 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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