Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms