Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a1O88207 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col5a1O88207 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Col5a1O88207 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col5a1O88207 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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