Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CaskO70589 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CaskO70589 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaskO70589 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaskO70589 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaskO70589 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaskO70589 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaskO70589 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaskO70589 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaskO70589 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms