Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp2a2O55143 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp2a2O55143 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms