Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap2O55126 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap2O55126 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms