Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dsg2O55111 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg2O55111 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms