Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrxO55103 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PrxO55103 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrxO55103 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrxO55103 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrxO55103 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrxO55103 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrxO55103 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrxO55103 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrxO55103 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrxO55103 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrxO55103 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrxO55103 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrxO55103 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrxO55103 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrxO55103 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrxO55103 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrxO55103 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrxO55103 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrxO55103 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrxO55103 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrxO55103 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrxO55103 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PrxO55103 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrxO55103 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrxO55103 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PrxO55103 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrxO55103 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrxO55103 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrxO55103 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrxO55103 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrxO55103 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrxO55103 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrxO55103 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrxO55103 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrxO55103 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrxO55103 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrxO55103 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrxO55103 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrxO55103 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrxO55103 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrxO55103 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrxO55103 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrxO55103 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrxO55103 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrxO55103 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrxO55103 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrxO55103 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PrxO55103 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrxO55103 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrxO55103 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrxO55103 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrxO55103 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms