Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp10aO54827 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp10aO54827 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms