Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffbO54788 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffbO54788 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffbO54788 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffbO54788 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffbO54788 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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