Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EdaO54693 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EdaO54693 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EdaO54693 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EdaO54693 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EdaO54693 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EdaO54693 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EdaO54693 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EdaO54693 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EdaO54693 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EdaO54693 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms