Protein–RNA interactions for Protein: O35949

Elovl3, Elongation of very long chain fatty acids protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elovl3O35949 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Elovl3O35949 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elovl3O35949 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms