Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccrl2O35457 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccrl2O35457 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms