Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atf6bO35451 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atf6bO35451 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atf6bO35451 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atf6bO35451 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Atf6bO35451 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf6bO35451 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atf6bO35451 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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