Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prrt1O35449 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prrt1O35449 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prrt1O35449 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prrt1O35449 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prrt1O35449 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Prrt1O35449 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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