Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xbp1O35426 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xbp1O35426 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms