Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptpn9O35239 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms