Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfra2O08842 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfra2O08842 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms